В МГУ появился цифровой гербарий, включающий в себя автоматическую геопривязку ИСТРА.
Специалисты НИИ физико-химической биологии имени Белозерского МГУ, совместно, с учёными биологического факультета МГУ пустили в ход систему ИСТРА (Интеллектуальная Система Топонимического Распознавания и Атрибутирования), автоматически привязывающую экземпляры растений к географической точке. Данная система даёт возможность в краткие сроки привязать сотни тысяч оцифрованных растительных образцов гербария из коллекции Цифрового гербария МГУ к точным географическим местам.
Данный проект получил поддержку со стороны Российского научного фонда (РНФ) в области другого проекта «Ноев Ковчег». Сегодня система ИСТРА выполняет свою работу в двух направлениях. Первое связано с совпадением текстового описания места, где собрали растение, с наклейкой образца с географическим названием. И второе – дата сбора гербарного экземпляра должна совпадать с именем собравшего растение.
В первом направлении предполагается обеспечить координатами один из экземпляров, который собрали, допустим, на Гурзуфской яйле возле Беседки Ветров в Крыму. Тогда мы можем получить точное местонахождение всех растений, которые попали в гербарий с этого места.
Во втором направлении результат менее точен. В нём идёт привязка алгоритма к одной точке всех растений, которые собирались исследователем в тот же день.
Комментируя разработку алгоритма ИСТРА, доктор биологических наук и ведущий научный сотрудник биологического факультета Алексей Серёгин говорит, что создание данного алгоритма – это реальная возможность создать атлас флоры России. Все растительные экземпляры, потупившие в Гербарий МГУ за последние 15 лет, уже снабжены точными географическими координатами, полученными при помощи портативных навигаторов.
Цифровой гербарий МГУ – это самая большая в мире база данных о растениях, их разнообразии и распространении. Она появилась на сведениях о 787 тысячах растений из Гербария им. Д. П. Сырейщикова. Цифровой гербарий состоит из трёх блоков, связанных между собой. Первый блок – это библиотека высококачественных изображений гербарных экземпляров. Второй блок – это базы данных текстовой информации, которая содержится на этикетках. И третий блок – это геоинформационная система с данными мест, где собирался гербарный экземпляр.
Работа над созданием Цифрового гербария МГУ выполнялась под руководством Алексея Серёгина по гранту РНФ «Научные основы создания Национального банка-депозитария живых систем». Тема входит в проект «Ноев Ковчег».
Сегодня Цифровой гербарий МГУ занимает первое место по количеству отсканированных образцов между университетами. Полная оцифровка фондов в гербарии университета ожидается в 2018 году.
редакция
© фото редакции
